猴痘疫情：刚果东部猴痘疫情发现新毒株I型b谱系，大多数感染者为年轻的性工作者

文章原名为《在东刚果民主共和国持续爆发的新猴痘病毒I型谱系》，由Emmanuel H. Vakaniaki博士等多位作者共同撰写。该研究文章发表在medRxiv平台上，版本发布日期为2024年4月14日。需要注意的是，这篇文章是一篇预印本，尚未经过同行评审，因此其研究结果不应作为临床实践的指导。

这篇文章报道了2023年10月在刚果民主共和国东部的卡米图加矿区爆发的一起猴痘疫情。研究人员通过收集监测数据、医院记录和进行基因组测序，发现了一个新的猴痘病毒I型b谱系，与已知的I型a病毒株有显著不同。疫情主要通过性接触传播，特别是在性工作者中传播较为显著，且大多数感染者为年轻人。

基因组分析显示，该病毒谱系存在APOBEC3型突变，表明了近期的人传人传播。研究结果强调了需要采取紧急公共卫生措施，如加强疫情监测、改善病例管理和对高风险人群进行疫苗接种，以防止疫情进一步扩散成为全国乃至全球性的流行病。

摘要

2022年，猴痘病毒（MPXV）因为一场主要通过性接触途径传播的大规模疫情而成为全球焦点。在中非尤其是刚果民主共和国，I型MPXV较为常见，它引发的疾病较为严重，死亡率可高达11%。而II型MPXV之前主要局限于西非，它引起的疾病相对较轻，死亡率也较低，不到4%。

研究人员在2023年10月至2024年1月期间，搜集了监测数据和医院的病历记录。在金沙萨的国家级生物医学研究单位进行了分子水平的诊断工作，通过采集血液和皮肤或喉咙拭子样本，利用Illumina NextSeq 2000测序平台和一系列生物信息学工具对猴痘病毒的基因组进行了深入分析。

在卡米图加地区，猴痘疫情的扩散速度非常快，在报告首例病例的5个月内，就有241个疑似病例被记录在案。在这些疑似病例中，有108例被确诊，其中近三分之一是性工作者，这一点突显了性行为作为传播途径的重要性。

通过基因组分析，研究人员发现了一种新的I型b猴痘病毒谱系，它与之前在DRC境内发现的I型病毒株有明显不同。APOBEC3基因突变的高发性和该病毒株大约在2023年9月中旬出现的时间点，都指向了近期人与人之间的传播。

为了控制这种可能引发新一波大规模流行的I型b猴痘病毒疫情，迫切需要采取一系列紧急措施，包括但不限于加强对疫情的监测和追踪接触者，改进病例管理工作，并针对性地实施疫苗接种计划。

引言

猴痘病毒（MPXV）在2022年因性接触相关疫情而成为全球焦点。该病毒分为两种基因谱系：I型主要在中非，尤其是刚果民主共和国，其引发的疾病较为严重，死亡率高；II型则在西非，引起的疾病较轻。2017年尼日利亚的II型b病毒疫情预示了2022年全球疫情的爆发。尽管全球疫情已减缓，但中非的I型感染率却在上升，特别是在动物宿主溢出后。

2023年10月，东刚果人口密集的卡米图加地区首次出现猴痘病例，本研究对此进行了详细调查。研究发现，该地区的猴痘病例与性接触有关，特别是性工作者中的感染率较高，且大多数感染者为年轻人。这些发现表明，猴痘病毒的传播模式可能正在发生变化，需要进一步的研究和监测来更好地理解其传播动态，并采取适当的预防措施。

研究结果

在2023年9月29日至2024年2月29日间，东刚果民主共和国南基伍省记录了241例疑似猴痘病例，主要集中于卡米图加卫生区，其中91%的病例需要住院治疗。通过PCR检测，108例疑似病例被确诊为MPXV阳性。确诊病例中大多数为年轻女性，中位年龄22岁，性工作者占相当比例。所有确诊病例均出现皮疹，多数有发热和淋巴结肿大症状，但住院数据库中无死亡记录。

基因组测序揭示了一个新的I型b猴痘病毒谱系，与DRC之前已知的I型病毒株有显著差异，且存在APOBEC3型突变，表明近期发生了人传人传播。疫情起源的估计时间约为2023年9月中旬。此外，来自卡米图加以外地区的样本基因组序列与I型a病毒株一致，显示与卡米图加疫情无关。这些数据支持了猴痘病毒通过性接触在卡米图加地区持续传播的流行病学调查结果，并强调了采取紧急公共卫生措施以控制疫情扩散的迫切性。

结果讨论

研究报告提出了一个新的I型MPXV谱系，即I型b，并指出该谱系与持续的人传人传播有关，建议将其与原先的I型区分开，后者重新命名为I型a。该新谱系只在卡米图加疫情中发现，但早期的片段序列表明它可能已在当地动物宿主中存在。

研究的优势在于提供了高质量的病毒基因组测序，尽管存在临床和人口统计信息有限的局限性。数据表明，卡米图加地区的传播主要与性接触有关，特别是影响到了青少年、年轻成人和性工作者。由于当地医疗基础设施的不足，以及疫情可能通过高流动性的人口扩散到邻近国家，这一持续传播现象引起了严重关切。

基因组证据显示，DRC在2022/2023年猴痘病例激增主要是由多个独立的动物宿主溢出事件引起的，而非单一的人类疫情。为了防止疫情进一步扩散，报告强调了采取紧急措施的必要性，包括加强监测、改善病例管理和对高风险人群进行疫苗接种。研究者呼吁国际社会和流行国家迅速采取行动，以避免全球性猴痘疫情的再次爆发。