猕猴免疫蛋白TRIM5α可以有效地阻止HIV入侵

猕猴在感染艾滋病毒时，有一种蛋白质，可以有效地阻止艾滋病毒颗粒的入侵。

芝加哥大学的一组科学家宣布了一项创新性的研究，解释了猕猴的免疫蛋白TRIM5α是如何发挥作用的。科学家们说，这也标志着在模拟复杂生物蛋白质如何自我组装的科学上迈出了重要的一步。

博士后研究员、该项研究的主要作者阿尔文•余（Alvin Yu）在《自然通讯》（Nature Communications）上说：“这些蛋白质共同作用，将艾滋病病毒衣壳包裹在一个六边形的网中，限制病毒的活动。”。

结果发现，部分机制似乎是晶格网中的缺陷不规则，这使得TRIM5α蛋白能够灵活地包裹入侵病毒所具有的任何形状。

余教授和格雷戈里·沃斯教授一直致力于通过计算机模拟来理解生物学过程的物理基础。但是，一个能够真实地代表HIV病毒中每个原子的模拟甚至可以轻易地压倒最大的超级计算机，因此有一种微妙的方法来选择哪些部分是模拟中至关重要的，哪些部分可以安全地像素化。这叫做“粗粒化”

他们把注意力转向TRIM5α蛋白的奥秘。余教授和沃斯教授知道TRIM5α可以形成二维晶格，但是关于这些蛋白质如何集体包裹三维衣壳的问题仍然需要研究。因此，他们进行了模拟，并根据其他关于其组成的实验所知，模拟了蛋白质之间以及入侵病毒之间的相互作用。

新模型提出了几个要点。一种是这种蛋白质利用一种复杂的“跳跃”机制在衣壳顶部逐渐积累，直到达到临界点。然后，随着晶格生长，蛋白质以这样的方式挤压在一起，晶格中开始出现不规则现象。