当HIV进入人体的CD4细胞时，HIV RNA首先会变为HIV DNA前病毒。然后将HIV前病毒嵌入CD4细胞的DNA中。当CD4细胞复制时，HIV前病毒会从一个细胞传递到下一个细胞，从而确保了HIV的持续复制。HIV使用整合酶将其病毒DNA插入（整合）到人体CD4细胞的DNA中。整合是艾滋病毒生命周期中的关键步骤是HIV复制周期中不可缺少的关键过程。目前的抗艾药物中，整合酶抑制剂（INSTI）可以阻碍HIV病毒进行整合。
由于HIV DNA会嵌入人体CD4细胞的DNA当中，所以一但感染HIV，即使是服用抗病毒药物（包括暴露后阻断药物），也无法将HIV DNA清楚。所以HIV DNA前病毒是人体在感染HIV后最早的生物标记，仅需3-7天的窗口期即可检测出，是目前窗口期最短的检测标志物。*
而且HIV DNA会进入人体的组织、器官、脑脊液中，形成HIV病毒库，为治愈HIV造成困难。
*中华人民共和国卫生行业标准《WS293-201艾滋病和艾滋病毒感染诊断》
1. HIV DNA核酸定性检测适用于HIV感染的早早期诊断
由于HIV DNA前病毒的窗口期短和无法被药物清除的两大特性，所以HIV DNA前病毒适用于HIV 感染的早早期诊断。如高危行为后的筛查，抗体不确定以及WB条带不全的待查人群以及服用PEP暴露后预防药物的人群。
2. HIV DNA核酸定性检测适用于婴幼儿的HIV筛查
根据中国艾滋病诊疗指南2018版的和全国艾滋病检测技术规范2020版的建议，HIV阳性孕妇所生的儿童应该出生后6周以及3个月进行HIV核酸检测，进行HIV感染早期诊断。HIV抗体检测在出生后12个月和18个月进行。核酸阴性而抗体阳性的HIV暴露儿童需在出生后24个月再进行一次HIV抗体检测，以明确感染状态。
3. HIV DNA核酸定量检测适用于阳性人群预测疾病治疗效果
由于HIV DNA进入人体后会形成病毒库，因此定期进行HIV DNA定量检测，不仅可以知晓抗病毒药物的治疗效果，而且可以预测病载反弹。在低病毒血症的感染者身上尤为使用。
HIV核酸检测分为定性和定量检测，均可用作HIV感染诊断。
HIV核酸定性检测包括RNA检测和DNA检测，RNA检测主要是检测血浆或血清中的RNA，DNA检测主要是检测全血、干血斑或组织细胞中的前病毒DNA或总核酸。二者相比，HIV DNA的稳定性更好*。
目前HIV核酸定性检测主要由RT-PCR法，荧光探针PCR法及以焦磷酸化激活聚合酶（PAP）反应为基础的核酸扩增PCR法*。
*全国艾滋病检测技术规范2020版
什么是PAP法？
焦磷酸化激活聚合酶法简称为PAP法，是新一代的核酸检测技术。PAP法拥有三十多国的专利，并且基于该技术的HIV-1 DNA检测试剂已通过CFDA的批准。
PAP法具有灵敏度高、选择性强、特异性高的特点，可以检测出1个拷贝的目标核酸分子，比现有的PCR技术高一百万倍以上。
